\documentclass[a4paper, oneside, 10pt]{article}
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\date{\today}
\title{}
\author{}
\begin{document}



\section{\texorpdfstring{Material de apoio}{Material de apoio}}
\label{sec:material_de_apoio}


\subsection{\texorpdfstring{Apresentação à Ecologia Vegetal}{Apresentaao a Ecologia Vegetal}}
\label{sec:apresentaao_a_ecologia_vegetal}


\subsubsection{\texorpdfstring{Slides da aula}{Slides da aula}}
\label{sec:slides_da_aula}

\begin{itemize}
  \item  Aula \href{http://prezi.com/mvm4owdddddj/popcomintro/?utm_campaign=share\&utm_medium=copy}{Aula Introdutória - Prezi}
  \item Aula \href{http://prezi.com/lykyquxndv6j/?utm_campaign=share\&utm_medium=copy\&rc=ex0share}{ População Estruturada - Prezi}
\end{itemize}


\subsubsection{\texorpdfstring{Outros recursos}{Outros recursos}}
\label{sec:outros_recursos}

\begin{itemize}
  \item \href{http://www.youtube.com/playlist?feature=c4-feed-u\&list=PLxI8Can9yAHclehOGB5PZmh4mBrh7Ar0e}{A vida secreta das plantas}, excelente série da BBC, disponibilizada pela \href{http://univesp.br/}{Universidade Virtual de São Paulo}.
  \item \href{http://en.wikipedia.org/wiki/Kunstformen_der_Natur}{Kunstformen der Natur}, famoso livro de litografias naturalísticas por \href{http://en.wikipedia.org/wiki/Ernst_Haeckel}{Ernst Haeckel}. A obra é de domínio público e as pranchas podem ser exploradas com \emph{zoom} \href{http://algorithmic-worlds.net/Haeckel/haeckel.php}{aqui}.
\end{itemize}


\subsection{\texorpdfstring{Dinâmica de populações}{Dinamica de populaoes}}
\label{sec:dinamica_de_populaoes}


\subsubsection{\texorpdfstring{Artigos para leitura e discussão}{Artigos para leitura e discussao}}
\label{sec:artigos_para_leitura_e_discussao}


\paragraph{\texorpdfstring{Principal}{Principal}}
\label{sec:principal}


Silva Matos, D. M., Freckleton, R. P., \& Watkinson, A. R. (1999). The role of density dependence in the population dynamics of a tropical palm. Ecology, 80(8), 2635-2650.

Além deste artigo principal você deve ler e fazer a ficha de um dos artigos a seguir. Qual? Veja a escala de leitura!

\paragraph{\texorpdfstring{Citados}{Citados}}
\label{sec:citados}

\begin{itemize}
  \item Condit, R., Hubbell, S. P., \& Foster, R. B. (1994). Density dependence in two understory tree species in a neotropical forest. Ecology, 671-680.
  \item Clark, D. A., \& Clark, D. B. (1984). Spacing dynamics of a tropical rain forest tree: evaluation of the Janzen-Connell model. American Naturalist, 769-788.
\end{itemize}


\paragraph{\texorpdfstring{Que citam}{Que citam}}
\label{sec:que_citam}

\begin{itemize}
  \item Bagchi, R., Swinfield, T., Gallery, R. E., Lewis, O. T., Gripenberg, S., Narayan, L., \& Freckleton, R. P. (2010). Testing the Janzen‐Connell mechanism: pathogens cause overcompensating density dependence in a tropical tree. Ecology letters, 13(10), 1262-1269.
  \item Fowler, N. L., Overath, R. D., \& Pease, C. M. (2006). Detection of density dependence requires density manipulations and calculation of λ. Ecology, 87(3), 655-664.
\end{itemize}


\subsubsection{\texorpdfstring{Slides da aula}{Slides da aula}}
\label{sec:slides_da_aula2}


\subsubsection{\texorpdfstring{Outros recursos}{Outros recursos}}
\label{sec:outros_recursos2}

\begin{itemize}
  \item \href{https://www.khanacademy.org/math/linear-algebra/alternate_bases/eigen_everything/v/linear-algebra--introduction-to-eigenvalues-and-eigenvectors}{Introduction to eigenvalues} no site de videoaulas \href{https://www.khanacademy.org}{Khan Academy}
  \item \href{http://ocw.mit.edu/courses/mathematics/18-06-linear-algebra-spring-2010/index.htm}{Linear algebra}: curso online do MIT. Uma abordagem original e muito didática para ensinar algebra linear, na qual estão os cálculos de autovalores usados neste módulo.
  \item \href{http://www.nature.com/scitable/knowledge/library/case-study-the-glorious-golden-and-gigantic-13261308}{The Glorious, Golden, and Gigantic Quaking Aspen}: conheça o \emph{Populus tremuloides}, que pode formar enormes florestas de rametas. Uma destas populações de rametas é possivelmente o maior organismo vivo do planeta \footnote{rimou! Mas vamos parar por aqui.}.
  \item \href{http://www.nature.com/scitable/knowledge/library/ignoring-population-structure-can-lead-to-erroneous-15128671}{Ignoring Population Structure Can Lead to Erroneous Predictions of Future Population Size}: uma boa ilustração da importância de considerar estrutura etária das populações.
\end{itemize}


\subsection{\texorpdfstring{Estrutura de populações}{Estrutura de populaoes}}
\label{sec:estrutura_de_populaoes}


\subsubsection{\texorpdfstring{Artigos para leitura e discussão}{Artigos para leitura e discussao}}
\label{sec:artigos_para_leitura_e_discussao2}

\begin{itemize}
  \item Neste módulo discutiremos 3 artigos: o principal, um citado e um que cita.
  \item Como dois são curtos e para aperfeiçoar a discussão:

  \begin{itemize}
    \item Todos os alunos devem \textbf{ler os três artigos}. 
    \item Todos os alunos devem \textbf{enviar fichas dos três artigos} 
  \end{itemize}
  \end{itemize}


\paragraph{\texorpdfstring{Principal}{Principal}}
\label{sec:principal2}

      \begin{itemize}
  \item Condit, R., Ashton, P. S., Baker, P., Bunyavejchewin, S., Gunatilleke, S., Gunatilleke, N., ... \& Yamakura, T. (2000). Spatial patterns in the distribution of tropical tree species. Science, 288(5470), 1414-1418.
\end{itemize}


\paragraph{\texorpdfstring{Citado}{Citado}}
\label{sec:citado}

\begin{itemize}
  \item Harms, K. E., Wright, S. J., Calderón, O., Hernández, A., \& Herre, E. A. (2000). Pervasive density-dependent recruitment enhances seedling diversity in a tropical forest. Nature, 404(6777), 493-495.
\end{itemize}


\paragraph{\texorpdfstring{Que cita}{Que cita}}
\label{sec:que_cita}

\begin{itemize}
  \item Lin, Y. C., Chang, L. W., Yang, K. C., Wang, H. H., \& Sun, I. F. (2011). Point patterns of tree distribution determined by habitat heterogeneity and dispersal limitation. Oecologia, 165(1), 175-184.
\end{itemize}


\subsubsection{\texorpdfstring{Slides da aula}{Slides da aula}}
\label{sec:slides_da_aula3}


\subsubsection{\texorpdfstring{Outros recursos}{Outros recursos}}
\label{sec:outros_recursos3}

\begin{itemize}
  \item \href{http://en.wikipedia.org/wiki/Spatial_ecology}{Verbete sobre ecologia espacial} na Wikipedia. Bom resumo!
  \item \href{http://www.spatstat.org/}{Projeto spatstat}: ferramentas de análise, cursos, manuais online.
\end{itemize}


\subsection{\texorpdfstring{Dinâmica de comunidades}{Dinamica de comunidades}}
\label{sec:dinamica_de_comunidades}


\subsubsection{\texorpdfstring{Artigos para leitura e discussão}{Artigos para leitura e discussao}}
\label{sec:artigos_para_leitura_e_discussao3}


Neste módulo discutiremos dois artigos. O principal é um artigo de teste de uma hipótese, como os anteriores. O outro é um artigo de revisão do contexto teórico no qual o principal se insere.

\textbf{ Todos devem ler os dois artigos e fazer uma ficha para cada um.}

Notem que segunda pegunta da ficha do artigo de revisão é diferente da pergunta feita para os artigos que citam dos módulos anteriores.

\paragraph{\texorpdfstring{Principal}{Principal}}
\label{sec:principal3}


Yu, D. W., Terborgh, J. W., \& Potts, M. D. (1998). Can high tree species richness be explained by Hubbell's null model?. Ecology Letters, 1(3), 193-199.

\paragraph{\texorpdfstring{Que cita (Revisão)}{Que cita Revisao}}
\label{sec:que_cita_revisao}


Alonso, D., Etienne, R. S., \& McKane, A. J. (2006). The merits of neutral theory. Trends in Ecology \& Evolution, 21(8), 451-457.

\subsubsection{\texorpdfstring{Slides da aula}{Slides da aula}}
\label{sec:slides_da_aula4}

\begin{itemize}
  \item \href{media/2014/matapoio/dinamica_comunidades.pdf}{dinamica\_comunidades.pdf}
\end{itemize}


\subsubsection{\texorpdfstring{Outros recursos}{Outros recursos}}
\label{sec:outros_recursos4}

\begin{itemize}
  \item \href{http://ctfs.arnarb.harvard.edu/webatlas/datasets/bci/}{Parcela permanente de Barro Colorado}: história, imagens, listas de espécies e muito mais.
\end{itemize}


\subsection{\texorpdfstring{Estrutura de comunidades}{Estrutura de comunidades}}
\label{sec:estrutura_de_comunidades}


\subsubsection{\texorpdfstring{Artigos para leitura e discussão}{Artigos para leitura e discussao}}
\label{sec:artigos_para_leitura_e_discussao4}

\begin{itemize}
  \item Neste módulo discutiremos 2 artigos: o principal e um que cita.

  \begin{itemize}
    \item Todos os alunos devem \textbf{ler os dois artigos}. 
    \item Todos os alunos devem \textbf{enviar fichas dos dois artigos} 
  \end{itemize}
  \end{itemize}


\paragraph{\texorpdfstring{Principal}{Principal}}
\label{sec:principal4}

      \begin{itemize}
  \item Clark, D.B., Palmer, M.W. \& Clark, D.A. (1999). Edaphic factors and the landscape-scale distributions of tropical rain forest trees.  Ecology 80(8), 2662-2675.
\end{itemize}


\paragraph{\texorpdfstring{Que cita}{Que cita}}
\label{sec:que_cita2}

\begin{itemize}
  \item Duque, A., Phillips, J.F., von Hildebrand, P., Posada, C.A., Prieto, A., Rudas, A., Suescun, M. \& Stevenson, P. (2009). Distance Decay of Tree Species Similarity in Protected Areas on Terra Firme Forests in Colombian Amazonia. Biotropica 41(5), 599-607
\end{itemize}


\subsubsection{\texorpdfstring{Slides da aula}{Slides da aula}}
\label{sec:slides_da_aula5}


\subsubsection{\texorpdfstring{Outros recursos}{Outros recursos}}
\label{sec:outros_recursos5}


Veja \href{media/2014/matapoio/04a_gurevitch_cap15_estrutcomunidades.pdf}{aqui} o capítulo 15 do livro de Gurevitch et al. (2006), que faz uma introdução a análises multivariadas e pode ajudar a entender melhor a atividade prática.

\end{document}
