====== Material de apoio ======
===== Apresentação à Ecologia Vegetal =====
====Slides da aula====
* Aula [[http://prezi.com/mvm4owdddddj/popcomintro/?utm_campaign=share&utm_medium=copy|Aula Introdutória - Prezi]]
* Aula [[http://prezi.com/lykyquxndv6j/?utm_campaign=share&utm_medium=copy&rc=ex0share| População Estruturada - Prezi]]
====Outros recursos====
* [[http://www.youtube.com/playlist?feature=c4-feed-u&list=PLxI8Can9yAHclehOGB5PZmh4mBrh7Ar0e|A vida secreta das plantas]], excelente série da BBC, disponibilizada pela [[http://univesp.br/|Universidade Virtual de São Paulo]].
* [[http://en.wikipedia.org/wiki/Kunstformen_der_Natur|Kunstformen der Natur]], famoso livro de litografias naturalísticas por [[http://en.wikipedia.org/wiki/Ernst_Haeckel|Ernst Haeckel]]. A obra é de domínio público e as pranchas podem ser exploradas com //zoom// [[http://algorithmic-worlds.net/Haeckel/haeckel.php|aqui]].
===== Dinâmica de populações =====
====Artigos para leitura e discussão====
=== Principal ===
Silva Matos, D. M., Freckleton, R. P., & Watkinson, A. R. (1999). The role of density dependence in the population dynamics of a tropical palm. Ecology, 80(8), 2635-2650.
Além deste artigo principal você deve ler e fazer a ficha de um dos artigos a seguir. Qual? Veja a [[2014:escala_fichas|escala de leitura]]!
=== Citados ===
* Condit, R., Hubbell, S. P., & Foster, R. B. (1994). Density dependence in two understory tree species in a neotropical forest. Ecology, 671-680.
* Clark, D. A., & Clark, D. B. (1984). Spacing dynamics of a tropical rain forest tree: evaluation of the Janzen-Connell model. American Naturalist, 769-788.
=== Que citam ===
* Bagchi, R., Swinfield, T., Gallery, R. E., Lewis, O. T., Gripenberg, S., Narayan, L., & Freckleton, R. P. (2010). Testing the Janzen‐Connell mechanism: pathogens cause overcompensating density dependence in a tropical tree. Ecology letters, 13(10), 1262-1269.
* Fowler, N. L., Overath, R. D., & Pease, C. M. (2006). Detection of density dependence requires density manipulations and calculation of λ. Ecology, 87(3), 655-664.
====Slides da aula====
====Outros recursos====
* [[https://www.khanacademy.org/math/linear-algebra/alternate_bases/eigen_everything/v/linear-algebra--introduction-to-eigenvalues-and-eigenvectors|Introduction to eigenvalues]] no site de videoaulas [[https://www.khanacademy.org|Khan Academy]]
* [[http://ocw.mit.edu/courses/mathematics/18-06-linear-algebra-spring-2010/index.htm|Linear algebra]]: curso online do MIT. Uma abordagem original e muito didática para ensinar algebra linear, na qual estão os cálculos de autovalores usados neste módulo.
* [[http://www.nature.com/scitable/knowledge/library/case-study-the-glorious-golden-and-gigantic-13261308|The Glorious, Golden, and Gigantic Quaking Aspen]]: conheça o //Populus tremuloides//, que pode formar enormes florestas de rametas. Uma destas populações de rametas é possivelmente o maior organismo vivo do planeta ((rimou! Mas vamos parar por aqui.)).
* [[http://www.nature.com/scitable/knowledge/library/ignoring-population-structure-can-lead-to-erroneous-15128671|Ignoring Population Structure Can Lead to Erroneous Predictions of Future Population Size]]: uma boa ilustração da importância de considerar estrutura etária das populações.
===== Estrutura de populações =====
====Artigos para leitura e discussão====
* Neste módulo discutiremos 3 artigos: o principal, um citado e um que cita.
* Como dois são curtos e para aperfeiçoar a discussão:
* Todos os alunos devem **ler os três artigos**.
* Todos os alunos devem **enviar fichas dos três artigos**
=== Principal ===
* Condit, R., Ashton, P. S., Baker, P., Bunyavejchewin, S., Gunatilleke, S., Gunatilleke, N., ... & Yamakura, T. (2000). Spatial patterns in the distribution of tropical tree species. Science, 288(5470), 1414-1418.
=== Citado ===
* Harms, K. E., Wright, S. J., Calderón, O., Hernández, A., & Herre, E. A. (2000). Pervasive density-dependent recruitment enhances seedling diversity in a tropical forest. Nature, 404(6777), 493-495.
=== Que cita ===
* Lin, Y. C., Chang, L. W., Yang, K. C., Wang, H. H., & Sun, I. F. (2011). Point patterns of tree distribution determined by habitat heterogeneity and dispersal limitation. Oecologia, 165(1), 175-184.
====Slides da aula====
====Outros recursos====
* [[http://en.wikipedia.org/wiki/Spatial_ecology|Verbete sobre ecologia espacial]] na Wikipedia. Bom resumo!
* [[http://www.spatstat.org/|Projeto spatstat]]: ferramentas de análise, cursos, manuais online.
=====Dinâmica de comunidades=====
====Artigos para leitura e discussão====
Neste módulo discutiremos dois artigos. O principal é um artigo de teste de uma hipótese, como os anteriores. O outro é um artigo de revisão do contexto teórico no qual o principal se insere.
** Todos devem ler os dois artigos e fazer uma ficha para cada um.**
Notem que segunda pegunta da ficha do artigo de revisão é diferente da pergunta feita para os artigos que citam dos módulos anteriores.
=== Principal ===
Yu, D. W., Terborgh, J. W., & Potts, M. D. (1998). Can high tree species richness be explained by Hubbell's null model?. Ecology Letters, 1(3), 193-199.
=== Que cita (Revisão) ===
Alonso, D., Etienne, R. S., & McKane, A. J. (2006). The merits of neutral theory. Trends in Ecology & Evolution, 21(8), 451-457.
====Slides da aula====
* {{:2014:matapoio:dinamica_comunidades.pdf}}
====Outros recursos====
* [[http://ctfs.arnarb.harvard.edu/webatlas/datasets/bci/|Parcela permanente de Barro Colorado]]: história, imagens, listas de espécies e muito mais.
===== Estrutura de comunidades =====
====Artigos para leitura e discussão====
* Neste módulo discutiremos 2 artigos: o principal e um que cita.
* Todos os alunos devem **ler os dois artigos**.
* Todos os alunos devem **enviar fichas dos dois artigos**
=== Principal ===
* Clark, D.B., Palmer, M.W. & Clark, D.A. (1999). Edaphic factors and the landscape-scale distributions of tropical rain forest trees. Ecology 80(8), 2662-2675.
=== Que cita ===
* Duque, A., Phillips, J.F., von Hildebrand, P., Posada, C.A., Prieto, A., Rudas, A., Suescun, M. & Stevenson, P. (2009). Distance Decay of Tree Species Similarity in Protected Areas on Terra Firme Forests in Colombian Amazonia. Biotropica 41(5), 599-607
====Slides da aula====
====Outros recursos====
Veja {{:2014:matapoio:04a_gurevitch_cap15_estrutcomunidades.pdf|aqui}} o capítulo 15 do livro de Gurevitch et al. (2006), que faz uma introdução a análises multivariadas e pode ajudar a entender melhor a atividade prática.