Laboratório de Ecologia de Florestas Tropicais

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====== Material de Apoio ======


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Os tutoriais e slides das aulas serão disponibilizados ao longo da disciplina

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===== Slides e vídeos de aula =====
=== Apresentação da disciplina ===
  * [[https://drive.google.com/file/d/1s5aVk-TP-rTtTTtUKgMK4p1z-YIys9rX/view?usp=sharing|Encontro síncrono (21/03)]]

=== Por que estudar estatística? ===
  * {{ :cursos:planeco:material:Aula1_Planeco2021_Praque.pdf |Slides Aula 1a: O papel da estatística na 
 ciência}}



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**//__Por que estudar estatística__//**

{{ youtube>QhjuFKTYKgA  |}}

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/*

  * [[https://drive.google.com/file/d/16HcX8ujCWKQx_H8NpOTO7bXrSDtWsbYB/view?usp=sharing|Aula síncrona 1a- Parte I]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1vsbCiYbqmortWIAYWAmlNYWaB4zG-Uxq/view?usp=sharing|Aula síncrona 1a- Parte II]]

*/

=== Teste de hipóteses ===
  * {{ :cursos:planeco:material:Aula2_Planeco2021_TesteHipoteses.pdf |Slides Aula 1b: Teste de hipóteses}}
  * {{ :cursos:planeco:material:Trabalho_Planeco2022.pdf|Slides: Como será a avaliação? }}
  * [[https://drive.google.com/file/d/18TnoxeQuH2xBWCYUyziU0Up7JGBaiQHx/view?usp=sharing| Aula síncrona Teste de Hipótese - Parte I (21/03)]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1z4HKmlHO7PCi_YZAT9qfXMaSS41vos7o/view?usp=sharing|Aula síncrona Teste de Hipótese - Parte II (21/03)]]
  * 

=== Entendendo o P-valor ===
  * {{ :cursos:planeco:material:aulaPvalue.pdf |Slides Aula 2: Entendendo o P-valor}}
  * [[https://drive.google.com/file/d/1w_23R7ONgMUITKSx397qh4agqb6oc-Xc/view?usp=sharing|Discussão síncrona aula P-valor]]
  *[[https://drive.google.com/file/d/13guZNOfXLycJi1XvaZTXlsIqlTZePeIr/view?usp=sharing|Discussão síncrona Tutorial P-valor - 23/03 tarde]]

=== Regressão linear ===
  *{{ :cursos:planeco:material:Aula3_RegressaoLinear.pdf |Slides Regressão Linear}}
  *[[https://drive.google.com/file/d/1UBP0BvHkdECaUNSYFAxo9xHY8_FgNeIg/view?usp=sharing|Aula síncrona - Regressão Linear - 25/03 manhã]]
  *[[https://drive.google.com/file/d/1QeOTAX7NLE3KmLrw3jxD8gvchNsB5C-P/view?usp=sharing|Encontro síncrono - Discussão 25/03 tarde]]

=== ANOVA ===
  * [[http://143.107.246.248/aulasAAO/aulaAnova.html#/|Slides Aula 3: Anova (html)]] ((Os slides desta aula ficam mal formatados em pdf, baixe o arquivo html e abra no seu browser que funciona bem!))
  * [[https://drive.google.com/file/d/1bn0V0YXlYgBnNNCCebhYVcU3vTNUahek/view?usp=sharing|Discussão vídeo-aula - 28/03 manhã]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1xJDldeIFZBUyJlJKZFsq_1KVJ0Gy4Aii/view?usp=sharing|Discussão tutorial - 28/03 tarde]]

===Delineamento e Planejamento===
  * [[https://youtu.be/tZJxxwlbSKg|Aula 01 - Conceitos importantes]]
  * {{ :cursos:planeco:material:Aula01_PlanejamentoDelineamento2021.pdf |Slides da Aula 01}}
  * [[https://youtu.be/zpKzRYlQ5JM|Aula 02 - Principais problemas em delineamentos]]
  * {{ :cursos:planeco:material:Aula02_PlanejamentoDelineamento2021.pdf |Slides da Aula 02}}
  * [[https://youtu.be/JmGQ1e1SsVU|Aula 03 - Delineamentos amostrais]]
  * {{ :cursos:planeco:material:Aula03_PlanejamentoDelineamento2021.pdf |Slides da Aula 03}}
  * [[https://youtu.be/Uhpv61Alar8|Aula 04 - Delineamentos experimentais]]
  * {{ :cursos:planeco:material:Aula04_PlanejamentoDelineamento2021.pdf |Slides da Aula 04}}
  * [[https://drive.google.com/file/d/1vasvXSt2gUWC-6d3eT_44WX2d7FsQcV3/view?usp=sharing|Discussão síncrona 30/03 tarde - Fechamento Anova e Delineamento I]]


/*
  * {{ :cursos:planeco:material:Etapas da atividade de delineamento_tarde_01_04_2022.pdf |}}
  * {{ :cursos:planeco:material:Atividade Delineamento Horoscopo 2022.pdf |Atividade de delineamento}}
  * [[https://drive.google.com/file/d/15BHzC6GY_bXSmI_94QDyuYrYIodKhNMJ/view?usp=sharing|Discussão síncrona 01/04 manhã - Delineamento]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/18FK3zmSYGBU4KOHkgFyo9B8cVCo3l4LJ/view?usp=sharing|Proposta Exercício horóscopo 01/04 - 13:30]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1rZ7J8kuX7h70XTXdx3ECNui8zalFqzym/view?usp=sharing|Continuação Proposta Exercício horóscopo 01/04 - 14:00]]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1gv-wpmOI2JFrEUl9wxKX_Mv_WbW-_S9x/view?usp=sharing|Apresentações - Horóscopo 02/04 - 15:45]]
*/

===Apresentações Projetos===
 
  * [[https://drive.google.com/file/d/1NQcjpPlyKPr-QmsF8oyHR4t_DonrwJ3n/view?usp=sharing|Apresentações - Parte I - 04/04 manhã]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1ZQ9m_cvmoj2NNEgfOptD0Dd0IoFR4z7z/view?usp=sharing|Apresentações - Parte II - 04/04 manhã]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1B_ZR0kKR2NMDvJKlM6-bUP68-cFpFWss/view?usp=sharing|Apresentações - Parte III - 04/04 tarde]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1jU0WBfxRWwaXNcxpYfOuh1I-yzvyIyGf/view?usp=sharing|Apresentações - Parte IV - 04/04 tarde]]

===Modelo Lineares Simples=== 

  * [[https://drive.google.com/file/d/14YDICcwHtCCf5tmIcAhrdoitxbG2e3Z9/view?usp=sharing|Dúvidas MLS I - manhã 06/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1CUIz7uPMqSwVZhnezga1o6ueBlj4z9DJ/view?usp=sharing|Discussão MLS I - tarde 06/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1UOM5ev7wv7Ox-S-JXlLcTfErCd_NX4jr/view?usp=sharing|Dúvidas MLS II - manhã 08/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/13t2Vp8CRheQwvNPOBDlDK_JZDjUncrJq/view?usp=sharing|Discussão MLS II - tarde 08/04]]


===Modelo Lineares Múltiplos===  

  * [[https://drive.google.com/file/d/1-G_gEzn8sIpAPjfTkn-rW6PuuRb31TSY/view?usp=sharing|Dúvidas MLM I - manhã 11/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1sHponz_bdbL1MOY6ldd0zEKp7EHCCPS_/view?usp=sharing|Discussão MLM I - tarde 11/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1Os-aRjl6XeQgw_DXivAlS6kTuPRkXUlp/view?usp=sharing|Discussão MLM II - tarde 13/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1KFqv-vDA2JQMCUf-M4HZZfq9IOcjpNYl/view?usp=sharing|Discussão MLM III - tarde 18/04]]

===Modelo Lineares Generalizados (GML)===  

  * [[https://drive.google.com/file/d/1RICRE7vZ6Gdu3SfT2YFBm2gRfPZgFmiC/view?usp=sharing|Discussão GLM contagem - tarde 20/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1s0V8hNqmvkOFoeT8fdQqz-t1OZRXY9uf/view?usp=sharing|Discussão GLM binomial - tarde 25/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1msWg223oD9WkQvB6iA8VkV8fHkeeE3JU/view?usp=sharing|Fechamento GLM - tarde 27/04]]


===Modelo Lineares Mistos (LMM) ===  
  * [[https://drive.google.com/file/d/1gsb2tU-VAn-JENM171cnL28R49iQJcaC/view?usp=sharing|Discussão LMM - tarde 29/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1_9f6ysIf5RSG0XPgjYZler6LqCNam1xd/view?usp=sharing|Fechamento LMM - tarde 02/05]]

/*

  * [[https://drive.google.com/file/d/18PMVBRiGGc3_xonSb8vDQJBfOlnbZYZS/view?usp=sharing|Aula síncrona 1b]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1Y0SCH9gXBm7kY05iA15zDMqJ-hpyzKgu/view?usp=sharing|Aula 2 - Entendendo o P valor]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1YRozvv9Bsj0MpBO4Q9Wz7TExT3yFQcbZ/view?usp=sharing|Discussão síncrona - tutorial Teste de Hipóteses]]
  * [[http://https://drive.google.com/file/d/1J6YzNtvSoUw3MyKQeOQld7fkPTB1ljBm/view?usp=sharing|Discussão Fechamento - 29/03]]


== Testes clássicos - Regressão ==
  * {{ :cursos:planeco:material:Aula3_RegressaoLinear.pdf |Slides Aula Regressão}} 

== Testes clássicos - ANOVA ==
  * [[http://143.107.246.248/aulasAAO/aulaAnova.html#/|Slides Aula 3: Anova (html)]] ((Os slides desta aula ficam mal formatados em pdf, baixe o arquivo html e abra no seu browser que funciona bem!))
  *[[https://drive.google.com/file/d/103cxdsWabNJR58kKakcOIEzuf0HXhWkT/view?usp=sharing|Aula 3 - ANOVA (Parte I)]]
  *[[https://drive.google.com/file/d/1rRg3YpDR91qzvjPFQWIkK5O15CubUC4q/view?usp=sharing|Aula 3 - ANOVA (Parte II)]]
  *[[https://drive.google.com/file/d/1qYJ07BzMU1p5lyIUn4O_tFSZ0BHSEs0F/view?usp=sharing|Discussão síncrona - tutorial ANOVA]]

==Delineamento e Planejamento==
  * [[https://youtu.be/tZJxxwlbSKg|Aula 01 - Conceitos importantes]]
  * {{ :cursos:planeco:material:Aula01_PlanejamentoDelineamento2021.pdf |Slides da Aula 01}}
  * [[https://youtu.be/zpKzRYlQ5JM|Aula 02 - Principais problemas em delineamentos]]
  * {{ :cursos:planeco:material:Aula02_PlanejamentoDelineamento2021.pdf |Slides da Aula 02}}
  * [[https://youtu.be/JmGQ1e1SsVU|Aula 03 - Delineamentos amostrais]]
  * {{ :cursos:planeco:material:Aula03_PlanejamentoDelineamento2021.pdf |Slides da Aula 03}}
  * [[http://https://drive.google.com/file/d/1eSWFZrkY6EEyF8u-nWOsNeI5Dk9LI9qa/view?usp=sharing|Discussão Síncrona I - 29/03]]
  * [[https://youtu.be/Uhpv61Alar8|Aula 04 - Delineamentos experimentais]]
  * {{ :cursos:planeco:material:Aula04_PlanejamentoDelineamento2021.pdf |Slides da Aula 04}}
  * [[http://https://drive.google.com/file/d/1kpayfirKth4X2YUNL6JGlZqOJVVDXfJL/view?usp=sharing|Discussão Síncrona II - 31/03]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1Ih2kLgXie7RrkJcKm3GWC9YkaQSL27mN/view?usp=sharing|Exercício Horóscopo - discussão I]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1gr8Utp-ttfAjXOVmWLX3HF6RQA2Ii1-t/view?usp=sharing|Exercício Horóscopo - discussão II]]

== Modelos Lineares Simples ==
  * [[http://143.107.246.248/aulasAAO/aulalm2019.html#/|Slides das aulas de Modelos lineares simples (html)]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1M5YOuwfy62N2qIoSeUHIgIy9-w5bhMBs/view?usp=sharing|Orientações gerais]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/15t8Wg_srDLdLBGTeMVFz1SdFWoC-DA9o/view?usp=sharing|Discussão síncrona tutorial Modelos Lineares Simples I - 07/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/11xXVNOqCukcQebHM1F6GYCq03JmIELoa/view?usp=sharing|Discussão síncrona tutorial Modelos Lineares Simples II - 09/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1ABoUUmuJwxeuxOiuRMz1V-ywa5Iv_dUX/view?usp=sharing|Discussão Fechamento - 12/04]]


== Modelos Lineares Múltiplos ==
  *[[http://143.107.246.248/aulasAAO/aulalmMultiplo2019.html#/|Slides das aulas de Modelos Lineares múltiplos - parte a (html)]]
  * {{ :cursos:planeco:material:ModelosMultiplos2019.pdf |Slides das aulas de Modelos Lineares múltiplos - parte b(pdf)}}
  * [[https://drive.google.com/file/d/1xcB4-E88sZXZrHCDOtNNbrSiJ5s6EHPf/view?usp=sharing|Discussão síncrona tutorial MLM I - 14/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/16Gj0emWcPL58T1cVDFxwpaHv4OdTwtJI/view?usp=sharing|Discussão síncrona tutorial MLM II - 16/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1pUMNFmmjzdFp8KQ5yBrts7G04laqy6Du/view?usp=sharing|Discussão síncrona tutorial MLM III - 19/04]]

== Modelos Lineares Generalizados ==
  *[[http://143.107.246.248/aulasAAO/aulaGLM2019.html#/|Slides das aulas de Modelos lineares generalizados (html)]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1VzTR66a6sOd0Tij2HSTW3OD2_QGknO9D/view?usp=sharing|Discussão síncrona tutorial GLM Ia - 23/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/19LaFHPtIH9D184gheP722_13m8elVkzK/view?usp=sharing|Discussão síncrona tutorial GLM Ib - 23/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1x26VgfiQNj8VRbTbglHIhKdQZTO8LF4Z/view?usp=sharing|Discussão síncrona tutorial GLM II - 26/04]]
  * [[https://drive.google.com/file/d/1JT9Vz2ED2hVryp8u_1XHBVrrZDOKGFSb/view?usp=sharing|Discussão síncrona Fechamento GLM - 28/04]]

== Modelos Lineares Mistos ==
  *[[https://drive.google.com/file/d/13VgjcghggLHgZ5qQEK5KwcUbeTU4QmNu/view?usp=sharing|Discussão síncrona LMM - 30/04]]



  * {{ :cursos:planeco:material:aulaPvalue.pdf |Aula 3a: Entendendo o P-valor}}
  * {{ :cursos:planeco:material:Aula3_RegressaoLinear.pdf | Aula 3b: Regressão linear simples}}
  * [[http://143.107.246.248/aulasAAO/aulaAnova.html#/|Aula 3b: Anova (html)]] ((Os slides desta aula ficam mal formatados em pdf, baixe o arquivo html e abra no seu browser que funciona bem!))
  * {{ :cursos:planeco:material:PlanejamentoDelineamento2020.pdf |Aula 4: Delineamento e Planejamento}}            
  * [[http://143.107.246.248/aulasAAO/aulalm2019.html#/|Aula 5: Modelos Lineares (html)]]
  *[[http://143.107.246.248/aulasAAO/aulalmMultiplo2019.html#/|Aula 6: Modelos Lineares II: múltiplas preditoras (html)]]
  * {{ :cursos:planeco:material:ModelosMultiplos2019.pdf |Aula 6: Modelos Lineares II: múltiplas preditoras (pdf)}}
  *[[http://143.107.246.248/aulasAAO/aulaGLM2019.html#/|Aula 7: Modelos Lineares Generalizados (html)]]
  * {{ :cursos:planeco:material:Modelos Lineares Generalizados.pdf |Aula 7: Modelos Lineares Generalizados (pdf)}}

*/
===== Recomendações trabalho =====
  *{{ :cursos:planeco:material:Trabalho_Planeco2022.pdf|}}

/*
  *{{ :cursos:planeco:planeco:material:aula2aPvalue.pdf | Aula 2a: P-valor}}
  *{{ :cursos:planeco:planeco:material:Aula2_Planeco2019.pdf |Aula 2b: Teste de hipóteses}}
  *{{ :cursos:planeco:material:Aula3_RegressaoLinear.pdf | Aula 3a: Regressão linear}}
  *[[http://143.107.246.248/aulasAAO/aulaAnova.html#/|Aula 3b: Anova (html)]]
  *{{ :cursos:planeco:material:PlanejamentoDelineamento2019.pdf |Aula 4: Delineamento e Planejamento}}
  *{{ :cursos:planeco:material:PowerAnalysisSampleSize_2019.pdf |Aula 5: Análise do Poder e Tamanho de Amostra}}
  *[[http://143.107.246.248/aulasAAO/aulalm2019.html#/|Aula 6: Modelos Lineares (html)]]
  *[[http://143.107.246.248/aulasAAO/aulalmMultiplo2019.html#/|Aula 7: Modelos Lineares II: múltiplas preditoras (html)]]
        * {{ :cursos:planeco:material:ModelosMultiplos2019.pdf |Aula 7: Modelos Lineares II: múltiplas preditoras (pdf)}}
  *[[http://143.107.246.248/aulasAAO/aulaGLM2019.html#/|Aula 8: Modelos Lineares Generalizados (html)]]
        * {{ :cursos:planeco:material:Modelos Lineares Generalizados.pdf |Aula 8: Modelos Lineares Generalizados (pdf)}}
  * {{ :cursos:planeco:material:glmm2019.pdf |Aula 9: Modelos Mistos (LMM e GLMM)}} 

*/
 
===== Leituras Recomendadas =====

==== TEMAS GERAIS ====

  * Mlodinow, L. 2009. O andar do bêbado - como o acaso determina nossas vidas. Zahar.
  * Salsburg, D. 2009. Uma senhora toma chá - como a estatítica revolucionou a ciência no século XX. Zahar.
  * Gotelli, N. & Ellison, A. 2010. Princípios de Estatística Ecológica. Artmed.
  * Bolker, B. 2008. Ecological Models and Data in R. Princeton University Press. 
  * Quinn, G.P. & Keough, M.J. 2002. Experimental design and data analysis for biologists. Cambridge University Press.
  * Wasserstein, R.L. & Lazar, N.A. 2016. The American Statistical Association (ASA) statement on p-values: context, process and purpose. The American Statistician, 70(2):129-133.
  * Crawley, M. 2012. The R book. Wiley.
  * Fox, J. & Weisberg, S. 2011. An R Companion to Applied Regression.
  * ** FOX, G. ; NEGRETE-YANKELEVICH, S. & SOSA, V.J. 2015. Ecological Statistics: Contemporary Theory
and Application. Oxford University Press. **


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**__Mais um livro de estatística?__**

Essa pergunta é lançada na apresentação do livro coordenado por Gordon Fox, Simoneta Negrete-Yankelevich e Vinicius Sosa, com a colaboração dos melhores na área de ecologia numérica:

** Ecological Statistics: Contemporary Theory and Application **

A resposta dada é bastante pertinente: os organizadores do livro argumentam que a estatística avançou muito nas últimas décadas e muitas novas técnicas surgiram, seja para unificar métodos considerados distintos ou para resolver novos problemas que não existiam no passado recente. A ideia do livro é apresentar essa visão contemporânea da estatística voltada para a ecologia e evolução. Os capítulos são parcialmente independentes, mas principalmente os primeiros tratam de conceitos importantes e mais gerais. Sugerimos fortemente que leiam a introdução, que apresenta um panorama dessa estatística moderna, que se completa com os primeiros 3 capítulos do livro.

Ao longo do curso, principalmente a partir da segunda semana, iremos sugerir a leitura de capítulos específicos, entre eles o capítulo 6 __Generalized linear models__ e o 13 __Linear and generalized linear mixed models__.

  
  Por fim: um bom livro que merece ser estudado!
 


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==== TEMAS ESPECÍFICOS ====

== TESTE DE SIGNIFICÂNCIA ==

{{ :cursos:planeco:material:The ASA Statement on p Values Context Process and Purpose.pdf |Wasserstein R.L. & Lazar, N.A. 2016. The ASA Statement on p-Values: context, process, and purpose. The American Statistician 70(2): 129-133.}} 

{{ :cursos:planeco:material:Nature 2019 Amrhein.pdf |Amrhein V.; Greenland S.; McShane B. et al. 2019. Retire statistical significance. Nature 567:305-307.}}

{{ :cursos:planeco:material:Methods Ecol Evol 2019 Dushoff.pdf |Dushoff J.; Klain M.P. & Bolker B.M. 2019. I can see clearly now: reinterpreting statistical significance. Methods in Ecology and Evolution 10(6): 756-759.}}

{{ :cursos:planeco:material:Chernobyl.pdf |Beresford N.A.; Scott E.M. & Copplestone D.2020. Field effects studies in the Chernobyl exclusion zone:lessons to be learnt. Journal of Environmental Radioactivity 211 105893.}}




===== Outra Fontes =====

  * [[https://www.google.com.br/url?sa=t&rct=j&q=&esrc=s&source=web&cd=1&cad=rja&uact=8&ved=0ahUKEwimo-m98sjZAhWCt1MKHeAWC7cQtwIIKDAA&url=https%3A%2F%2Fwww.ted.com%2Ftalks%2Furi_alon_why_truly_innovative_science_demands_a_leap_into_the_unknown&usg=AOvVaw34sQtz6JPMpa1R_OPnoxSq|Uri Alon: a não linearidade da Ciência]]
  * [[https://students.brown.edu/seeing-theory |Seeing Theory - a visual introduction to probability and statistics]]
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