eco.odd                package:unknown                R Documentation

~~ Cálculo da similaridade ecológica - Ecological Oddity (Redding et al. 2010) ~~

Descrição:

Calcula a similaridade ecológica - Ecological Oddity - conforme proposto por Redding et al. (2010).

Uso:

eco.odd(x, N). 	

Argumentos:

x		data frame ou matriz com os dados brutos.
N 		argumento numérico indicando o número da última coluna na qual constam dados contínuos.


Detalhes:
O data frame com os dado brutos deve ser importado utilizando header = TRUE, e row.names=1, de modo que as espécies estejam indicadas nas linhas e as variáveis utilizadas para calcular a singularidade ecológica estejam nas colunas. 
É necessário ainda, que o arquivo esteja organizado com os dados contínuos nas primeiras colunas e os categóricos nas últimas. 
O valor de singularidade ecológica só será calculado para as espécies para as quais no mínimo 50% dos dados estiverem disponíveis. 

Valor:
data: retorna uma matriz com os valores de singularidade ecológica por espécie e por variável, com os nomes do data frame original das espécies e das variáveis. 

Ecological Oddity: retorna o valor de singularidade ecológica por espécie.

Rank EO: retorna os valores de singularidade ecológica ordenados por espécie em ordem crescente, excluindo as espécies para as quais não foi possível calcula-lo. 
 
Author(s):

Marília P. Gaiarsa
gaiarsa.mp@gmail.com

Agradeço à Hamanda Badona Cavalhieri pela ajuda, principalmente com os “fors”.

References:
Redding, D.W., Dewolff, C.V & Mooers, A.Ø. 2010. Evolutionary distinctiveness,threat status, and ecological oddity in primates. Conservation Biology, 24(4): 1052-8.

Exemplos:
dados<-as.data.frame(matrix(c(23,34,56,12,50, 3.4, 2,3,4,2.4, 3,4,5,2,3,"x", "y", "z", "x", "y", "a","b","a","b","a"),5,5)) #criando um vetor com dados  
colnames(dados)<-paste("variavel",1:5)
rownames(dados)<-paste("Sp",1:5)
eco.odd(dados,3)