Laboratório de Ecologia de Florestas Tropicais

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====== Coleta de dados por dispositivo móvel ======

[[https://opendatakit.org/|Open Data Kit]] é um projeto colaborativo de código aberto para coleta, armazenamento e gerenciamento de dados. A proposta é disponibilizar instrumentação de baixo custo para coleta de dados que possa ser utilizada em áreas remotas e sem infraestrutura de internet. Permite a coleta de dados tanto online quanto offline e tem a possibilidade de descarregar dados quando se conecta a rede.

Desenvolvemos um formulário baseado nessa plataforma para fazer o censo da Parcela Permanente da Ilha do Cardoso. 
Para ter mais controle sobre o processo decidimos usar apenas a interface de coleta de dados, chamada <wrap hi>**ODKCollect**</wrap> e não todo o ecossistema OKD. Para utilizá-lo é preciso instalar o **ODKCollect** através da **Play Store** em dispositivo móvel Android, de preferência um tablet, mas um smartphone dá conta do recado.
Depois de instalado é necessário inserir os arquivos dos formulários e dos dados anteriores da parcela no dispositivo para ativar o formulário.

===== Instalando o formulário PEIC =====


Vamos usar um formulário chamado **CensoPeicNoMiss**. Esse formulário é chamado //NoMiss// porque ao fechar uma subparcela, não solicita a conferência das árvores que não foram encontradas no censo atual e que estavam vivas no censo anterior, nessa mesma sub-parcela. Como esse processo é demorado, vamos dispensá-lo nessa atividade didática, mas lembrem-se de checar as árvores não encontradas, para termos certeza que não foram apenas esquecidas.

Ao instalar o aplicativo **ODKCollect** no dispositivo móvel, uma pasta **odk** será criada na memória de **Armazenamento interno** do dispositivo. Essa pasta tem as seguintes subpastas:

  * pasta odk:
      - instances
      - forms
      - metadata
      - layer

Para usar o aplicativo vamos precisar colocar os arquivos e subpastas dentro da pasta <wrap hi>**forms**</wrap>:

  * O formulário de entrada de dados: {{ :dicas_mat_apoio:censoPeicNoMiss.xml |}}
  * Uma pasta de mídia, que precisa ser criada, com o nome exato **<wrap hi>censoPeicNoMiss-media</wrap>**, contendo:
      * dados do censo anterior: {{ :dicas_mat_apoio:peic09.csv |}} 
      * lista das espécies: {{ :dicas_mat_apoio:peic09splist.csv |}}
      * imagem para mapeamento: {{ :dicas_mat_apoio:gridMap.svg |}} 
      * imagem para seleção da sub-parcela: {{ :dicas_mat_apoio:map20.svg |}} 
      * imagem com o mapeamento das árvores que irá trabalhar
          * selecione na [[https://drive.google.com/drive/folders/16OlNwInQO-op6VY4Iu5zm_KGKI1_ZcJ2?usp=sharing|pasta do drive]] as sub-parcela que irá trabalhar, dentro da pasta da linha correspondente;
          * baixe apenas as imagens da parcela, para não sobrecarregar a memória;
          * os arquivos das imagens devem estar diretamente na pasta **<wrap hi>censoPeicNoMiss-media</wrap>**, sem as subpastas do drive;
          * imagens de mais de uma parcela podem ser carregadas juntas, portanto, coloque todas que irá usar na pasta **<wrap hi>censoPeicNoMiss-media</wrap>**.

==== Estrutura de arquivos ====

Ao final do processo a pasta **odk** deve ter a seguinte estrutura de arquivos no seu dispositivo móvel ((no caso com imagens do mapeamento das árvores da parcela A00)).


<WRAP center round box 100%>
{{:dicas_mat_apoio:odkFilesEstr.png?700|}}
</WRAP>

Essa estrutura de arquivos só será assim no momento que os arquivos são transferidos. Na primeira vez que abrir o aplicativo odk no seu dispositivo móvel, alguns arquivos (os com extensão csv) serão transformados e armazenados em outra pasta. 

===== Usando o formulário CensoPeic =====
Abra o aplicativo e siga a sequência de eventos e seleções descritas abaixo. 
<WRAP center round important 80%>

Para avançar entre as páginas do formulário deve-se usar o gesto do indicador da esquerda para a direita.

</WRAP>

==== Página inicial ====

No **//__Menu Principal__//** selecione a opção:

<code>
  * Formulário em branco
</code>

Deve aparecer o nome do formulário xml que foi copiado para o dispositivo. Caso não apareça, houve algum problema , verifique se foi copiado na pasta correta. Selecione:
  
  * CensoPeicNoMiss


 <WRAP center round box 70%>


{{:dicas_mat_apoio:odkTelaIncial.jpg?200  |}}
{{  :dicas_mat_apoio:odkSelForm.jpg?200|}}



</WRAP>


==== Coordenada GPS ====

Aqui é possível coletar o ponto de GPS caso seu dispositivo tenha essa funcionalidade. Não precisamos, mas caso queira coletar, faça no ponto de inicio da sub-parcela ((canto inferior esquerdo em relação a origem da parcela A00)). O processo pode demorar alguns minutos, portanto, faça isso logo que chegar ao inicio da sub-parcela, enquanto organizam a equipe.

<code>
  * Inicia GeoPoint
</code> 

Siga passando a página de georreferenciamento, sem selecionar.

<WRAP center round tip 60%>
Caso tenha incluído algum registro errado ou onde não deveria, para apagar, inclusive em barra de rodagem ou novo grupo criado por engano, é preciso segurar o toque do dedo no registro por alguns segundos para aparecer a opção de apagar na tela.
</WRAP>

==== Equipe ====

Aqui é selecionado o nome da equipe que irá fazer o censo. Como os alunos não estão cadastrados devem incluir os nomes das pessoas, selecionando:




{{:dicas_mat_apoio:odkEquipe.jpg?200  |}}
 
<WRAP center round box 60%>
  * Equipe Nomes
        * Novo integrante não cadastrado
            *  Nome não cadastrado: <wrap hi>//preencher com o primeiro nome de cada integrante da equipe separado por vírgula//</wrap>
  * Responsável da Equipe
        * Novo integrante não cadastrado
</WRAP>

==== Parcela ====

Selecione a **__Coluna da Parcela__** e **__Linha da Parcela__** da parcela de 20 x 20 m que irá trabalhar. As colunas são designadas por letras de A a P e as linhas por números de 00 a 15. A **__Condição do piquete__** e **__Observações sobre o quadrat__** não são campos obrigatórios. Preencha se sentir necessidade.

Selecione em seguida a sub-parcela de 5 x 5 m que é a unidade de trabalho em campo, diretamente no mapa da tela. Confira se a seleção está correta no campo **__Selecionado:__** abaixo do mapa.
<WRAP center round box 70%>

{{:dicas_mat_apoio:odkSelParc.jpg?200  |}}
{{  :dicas_mat_apoio:odkSelSubQuad.jpg?200|}}  

</WRAP>

==== Árvores ====





A atividade que será executado durante o censo em cada árvores em parte depende de algumas condições, a principal delas é a presença ou não da placa e se o indivíduo está ou não morto. A primeira seleção ao iniciar a coleta de dados de uma árvore é definir esses estados, como mostra a figura. 

Em seguida é preciso indicar o número da placa que identifica cada árvore na parcela. No nosso censo há dois tipos de árvores com placas: aquelas que já estavam plaqueadas no censo anterior ((2009-2010)) e aquelas que foram plaqueadas no censo atual. Caso a árvore tenha sido plaqueada anteriormente, o número da placa deve aparecer na lista de árvores plaqueadas nas duas janelas de **__Árvores já anotadas:__**. A primeira mostra os números de placas associadas à sub-parcela e a segunda mostra todas as placas de árvores que estavam vivas no censo anterior. Caso o número não esteja nessas duas listas, significa que a árvore foi plaqueada no censo atual e precisa coletar todos os dados associadas a ela.


Caso nenhum número tenha sido selecionado aparecerá a página **__Número de placa antiga__**((Isso foi uma adaptação para a nossa atividade, esse caminho era para árvores plaqueadas que não foram encontradas no último censo, mas serve para os nossos propósitos)) onde deve ser inserido o número da placa. 

 <WRAP center round box 100%>
 

{{:dicas_mat_apoio:odkTreePlaca.jpg?200|}}
{{:dicas_mat_apoio:odkTagNumbI.jpg?200|}}
{{:dicas_mat_apoio:odkNewNumbTag.jpg?200|}}

</WRAP>

A próxima página **__A placa está em boas condiçoes?__** deve ser respondida com sim ou não. Verifique se a placa está legível e bem fixadas, caso contrário anote **__não__**.


==== Mapeamento ====

<WRAP center round box 80%>

{{:dicas_mat_apoio:odkMapea.jpg?200  |}}

Caso seja uma árvores com número novo, incluída no censo atual, deve-se fazer o mapeamento dela. Nesse caso, aparecerá um mapa com um grid em intervalos de 0,5 m. Esse grid representa a sub-parcela de 5 x 5 m. Deve-se selecionar a posição da árvore nesse grid, o que fornece uma precisão no mapeamento suficiente para análises que necessitam da posição da árvore.   

</WRAP>


<WRAP center round important 60%>
Caso a árvore já tenha sido mapeada em censos anteriores irá aparecer o mapa da parcela com a localização das árvores para confirmar o mapeamento. Caso não seja confirmado o mapeamento antigo, será solicitado que a árvore seja mapeada novamente, seguindo o mesmo procedimento de uma árvores nova.
</WRAP>

==== Altura e tipo de medida ====

Nessa página, será coletada duas informações, a altura da árvore e qual a medida da circunferência do tronco que iremos tomar. O ponto de medidas no tronco é tomado a 1,3 m do solo (altura do peito) por padrão. São três tipos de medidas possíveis, duas associados ao DAP (diâmetro a altura do peito) e uma associada ao PAP (perímetro a altura do peito):

<WRAP center round box 80%>

{{:dicas_mat_apoio:odkAlt.jpg?200   |}}

  * **__DAP com paquímetro__**: árvores pequenas, com menos de 5 cm (50 mm) de diâmetro **devem** ser medidas com paquímetro. O aplicativo permite que até diâmetros de 8 cm sejam medidos com paquímetro, diâmetros maiores devem necessariamente ser medidos com outro método. <wrap hi>A medida aqui é feita em **mm** inteiros, sem casas decimais</wrap>.


  * **__DAP com fita diamétrica__**: um tipo especial de fita cuja escala retorna o diâmetro associado ao perímetro medido, ou seja uma fita com escala de π cm.  


  * **__PAP com fita métrica__**: fita métrica normal, que mede o perímetro da árvores (cm).  

</WRAP>


==== Medida de DAP ou PAP ====

<WRAP center round box 80%>

{{:dicas_mat_apoio:odkDAP.jpg?200  |}}
Meça o diâmetro ou perímetro conforme o método de medida definido. Lembre-se que as escalas podem estar em //cm// ou //mm//, verifique se está anotando na escala correta. 

Responda a pergunta  **__Árvore com um fuste?__** (tronco principal). Anote **__não__** se a árvores tiver mais de um fuste (tronco) principal.

</WRAP>

==== Fuste secundário ====

<WRAP center round box 80%>

{{:dicas_mat_apoio:odkMedSecFuste.jpg?200  |}}

Caso tenha anotado **__não__** para fuste único, o aplicativo iniciará um ciclo de medidas de fustes. A cada ciclo aparecerá a página **__Adicionar Novo Grupo?__**. Selecione  **__Adicionar Grupo__**, caso tenha mais fustes para serem medidos.

Após medir todos os  fustes deve selecionar **__Não adicionar__** nessa janela, para prosseguir.

Para cada fuste deve ser tomada a medida de diâmetro (paquímetro ou fita diamétrica) ou perímetro (fita métrica). 


</WRAP>


==== Identificação Botânica ====

Para identificação botânica será apresentada a lista de familias, gêneros e espécies nessa ordem, sempre que o nível hierárquico acima tenha sido identificado. Caso a família não tenha sido identificada, o aplicativo não mostrará os gêneros e a identificação fica indeterminada para todos os níveis.

<WRAP center round box 100%>

{{:dicas_mat_apoio:odkSelFam.jpg?200|}}
{{:dicas_mat_apoio:odkSelGenus.jpg?200|}}
{{:dicas_mat_apoio:odkSelSP.jpg?200|}}


</WRAP>
  
  
Em seguida aparecerá a janela **__Coletar amostra botânica__** que não precisa ser anotada.




==== Confere Árvore ====

O registro de dados de cada árvore se fecha com a tela com todos os dados anotados para a árvore para serem conferidos e confirmados. Caso todos os dados estejam corretos siga selecionando **__Sim e adicionar árvore__** caso ainda tenham árvores na sub-parcela para serem anotados, ou **__Sim, não há mais árvores__** caso seja a última árvore para tomar dados na parcela. Nesse caso, aparecerá a janela que pergunta se quer incluir novo grupo de árvore ou sub-parcelas. Depois de responder não a todos os grupos aparecerá a janela solicitando **__Salvar e Sair__**.  Antes de sair coloque, indique no nome do formulário a ser salvo a parcela e sub-parcela a que se refere, por exemplo: **__censoPeicNoMissA00-5-15__** indicando que os dados se referem a sub-parcela **__5 x 15__** da parcela **__A00__**.


<WRAP center round box 100%>

{{:dicas_mat_apoio:odkEndTree.jpg?200|}}
{{:dicas_mat_apoio:odkNewSubQuad.jpg?200|}}
{{:dicas_mat_apoio:odkSalvaForm.jpg?200|}}



</WRAP>


==== Encaminhando os dados ====

Cada equipe deve, ao final da atividade, salvar a pasta **__odk__** com todas as subpastas, e encaminhar para os professores.
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