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cursos:ecor:02_tutoriais:tutorial1b:start [2020/07/31 16:58] adalardo [Instalando Pacotes] |
cursos:ecor:02_tutoriais:tutorial1b:start [2020/07/31 18:16] adalardo [Esquema do Mapa do R] |
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===== Instalando Pacotes ===== | ===== Instalando Pacotes ===== | ||
- | Quando estamos trabalhando em uma oficina normalmente chegamos a um ponto em que precisamos de uma ferramenta que não está disponível localmente. Nesses momentos precisamos nos deslocar até uma loja especializada para adquirir as ferramentas necessárias. As loja do R são os repositórios de pacotes, oficial é o CRAN [[https://cran.r-project.org/]]. | + | {{:cursos:ecor:02_tutoriais:tutorial1b:18.png?400 |}}Quando estamos trabalhando em uma oficina normalmente chegamos a um ponto em que precisamos de uma ferramenta que não está disponível localmente. Nesses momentos precisamos nos deslocar até uma loja especializada para adquirir as ferramentas necessárias. As loja do R são os repositórios de pacotes, oficial é o CRAN [[https://cran.r-project.org/]]. |
Entre os três principais repositórios ((CRAN, GitHub e Bioconductor)), em consulta feita em 31 de julho de 2020, existiam 20.205 pacotes contendo mais de **3,1 milhões de funções** disponíveis para o R(([[https://www.rdocumentation.org/]]))! | Entre os três principais repositórios ((CRAN, GitHub e Bioconductor)), em consulta feita em 31 de julho de 2020, existiam 20.205 pacotes contendo mais de **3,1 milhões de funções** disponíveis para o R(([[https://www.rdocumentation.org/]]))! | ||
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- | install.packages() | + | install.packages(pkgs = "vegan") |
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+ | Agora vamos verificar se o pacote está instalado consultando o ''help.start()'' e virificando se aparece na na lista de pacotes instalados. Vá no link abaixo do ''Descrition File'' denominado ''User guides, package vignettes and other documentation'' e abra o documento com o tema ''Diversity analysis in vegan''. | ||
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+ | help.start() | ||
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+ | Vá no link ''Packages'' e selecione o pacote ''vegan'' na lista de pacotes. A página inicial do pacote com o título **Community Ecology Package** conterá o link para a documentação de cada uma das funções do pacote. São muitas, mais de 500! Felizmente a documentação do pacote é muito completa e tem alguns tutoriais incluídos que são chamados de ''Vignettes''. Essas vinhetas são de grande ajuda para quem precisa estudar um pacote. Abra a vinheta sobre ''Diversity analysis in vegan'', navegue no documento. São 12 páginas condensadas sobre análises de diversidade, mostrando como faze-las no ''vegan'' e com exemplos muito ilustrativos. | ||
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+ | ===== Esquema do Mapa do R ===== | ||
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+ | Esse tutorial é uma base muito importante para que o usuário se torne fluente na linguagem e se posicione no ambiente de programação. Uma boa sugestão é retornar a esse tutorial depois que tiver alguma experiência no R para sedimentar os conceitos aqui apresentados. Abaixo o esquema que apresentamos em aula e no inicio desse tutorial. Garanta que consegue se localizar nele. | ||
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+ | <WRAP center round box 100%> | ||
+ | **__MapeaR__** | ||
+ | {{:cursos:ecor:02_tutoriais:tutorial1:mapa20.png?1000 |}} | ||
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