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cursos:planeco:roteiro:12-glmm

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cursos:planeco:roteiro:12-glmm [2020/04/26 14:08]
adalardo [Modelos Mistos Generalizados (GLMM)]
cursos:planeco:roteiro:12-glmm [2021/04/30 15:42] (atual)
adalardo
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-====== Modelos ​Mistos ​Generalizados (GLMM) ======+ 
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 +  * [[cursos:​planeco:​roteiro:​12-glmm_rcmdr|{{:​planeco:​logorcmdr01.png?​20|}}]] 
 +  * [[cursos:​planeco:​roteiro:​12-glmm|{{:​planeco:​rlogo.png?​20|}}]] 
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 +====== Modelos Generalizados ​Mistos ​(GLMM) ====== 
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 +Veja esse roteiro associado ao Rcmdr [[cursos:​planeco:​roteiro:​12-glmm_rcmdr|aqui]] 
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 Este roteiro é uma continuação do roteiro de [[cursos:​planeco:​roteiro:​11-lmm|]] (LMM), o qual deve ser feito e entendido bem antes de continuar. Também é importante que você já tenha estudado o roteiro de [[cursos:​planeco:​roteiro:​10-glm|]] (GLMs). Os modelos GLMM são uma extensão dessas duas abordagens reunidas. Este roteiro é uma continuação do roteiro de [[cursos:​planeco:​roteiro:​11-lmm|]] (LMM), o qual deve ser feito e entendido bem antes de continuar. Também é importante que você já tenha estudado o roteiro de [[cursos:​planeco:​roteiro:​10-glm|]] (GLMs). Os modelos GLMM são uma extensão dessas duas abordagens reunidas.
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 <WRAP center round box 80%> <WRAP center round box 80%>
  
-**__Gráfico ​básico de diagnóstico do Rcmdr com a distribuição dos resíduos do modelo selecionado no roteiro [[cursos:​planeco:​roteiro:​11-lmm|]].__**+Gráfico ​básico de diagnóstico do Rcmdr com a distribuição dos resíduos do modelo selecionado no roteiro [[cursos:​planeco:​roteiro:​11-lmm|]].
  
 {{  :​cursos:​planeco:​roteiro:​digPraia.png?​500 ​ |}} {{  :​cursos:​planeco:​roteiro:​digPraia.png?​500 ​ |}}
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 ==== Voltando aos dados da riqueza de espécies das praias ==== ==== Voltando aos dados da riqueza de espécies das praias ====
  
-Vamos voltar ​ao exemplo do livro do Zuur et al. (2009), no qual queremos entender se a riqueza de espécies da macro-fauna em 9 praias na costa da Holanda é influenciado pela altura da estação de amostragem em relação à altura média da maré (`NAP`) ((vamos começar com o modelo mais simples)). As unidades amostrais estão aninhadas dentro das praias, ou seja, temos 5 valores por praia que não podem ser consideradas independentes,​ e por isso incluímos no nosso modelo a praia como um efeito aleatório.+Vamos retornar então ​ao exemplo do livro do Zuur et al. (2009), no qual queremos entender se a riqueza de espécies da macro-fauna em 9 praias na costa da Holanda é influenciado pela altura da estação de amostragem em relação à altura média da maré (''​NAP''​) ((vamos começar com o modelo mais simples)). As unidades amostrais estão aninhadas dentro das praias, ou seja, temos 5 valores por praia que não podem ser consideradas independentes,​ e por isso incluímos no nosso modelo a praia como um efeito aleatório((veja o roteiro [[cursos:​planeco:​roteiro:​11-lmm|]] )).
  
 Dados de contagem, ou seja, o número de espécies em cada amostra, são geralmente modelados com a distribuição de **Poisson**,​ que assume também que a média é igual à variância. Ou seja, se a média aumenta, a variância também. ​ Dados de contagem, ou seja, o número de espécies em cada amostra, são geralmente modelados com a distribuição de **Poisson**,​ que assume também que a média é igual à variância. Ou seja, se a média aumenta, a variância também. ​
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 Então, mãos à massa! ​ Então, mãos à massa! ​
 ==== Lendo os dados no R ==== ==== Lendo os dados no R ====
 +
 +Depois de ler os dados no Rcmdr precisamos modificar a variável ''​fExp''​ para nomear os níveis. Como fizemos no roteiro do **LMM**.
  
   * baixe o arquivo {{ :​cursos:​planeco:​roteiro:​praia.txt |dados vamos à praia}}   * baixe o arquivo {{ :​cursos:​planeco:​roteiro:​praia.txt |dados vamos à praia}}
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   * o arquivo é do tipo texto, com colunas separadas por tabulação ("​Tabs"​) e com decimal indicado por ponto ("​."​)   * o arquivo é do tipo texto, com colunas separadas por tabulação ("​Tabs"​) e com decimal indicado por ponto ("​."​)
   * crie a variável ''​fExposure''​ como fator, como fizemos no LMM   * crie a variável ''​fExposure''​ como fator, como fizemos no LMM
 +
  
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cursos/planeco/roteiro/12-glmm.1587920920.txt.gz · Última modificação: 2020/04/26 14:08 por adalardo