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Passo 01 - Preparar Arquivo de Localidades
Passo 01 - Preparar Arquivo de Localidades
Deve conter as seguintes colunas (sendo cada linha um Quadrante):
Localidade | Reserva | LatReserva | LongReserva | Parcela | LatParcela | LongParcela | Quadrante | Xquad | Yquad |
Gavião | 1101 | -2.345 | -60.4567 | 1101-1 | -2.456 | -60.345 | 25 | 80 | 80 |
Passo 02 - Preparar Arquivo Importação de todas as árvores já marcadas
Passo 02 - Preparar Arquivo Importação de todas as árvores já marcadas
Num primeiro momento deve conter as seguintes colunas (sendo cada linha uma árvore):
Parcela | Quadrante | Tagnum | Habito |
1101-1 | 25 | 1230 | Árvore |
Num segundo momento importamos o X e Y de cada árvore:
Parcela | Quadrante | Tagnum | Xarv | Yarv |
1101-1 | 25 | 1230 | 14.2 | 2.2 |
Passo 03 - Arquivos Identificações
Passo 03 - Arquivos Identificações
Identificações - vários arquivos com histórico das identificações do FITO.
Para preparar arquivos
Para preparar arquivos
Quando for indeterminado colocar Indet na coluna correspondente Se o modificador fizer parte do nome incluir na coluna correspondetne, senão colocar cf. aff. na coluna modificadores Colocar AutorEspecie apenas para morfotipos (o resto não precisa) Determinador: quando tiver mais de um separar por ;
Parcela | Quadrante | Tagnum | Familia | Genero | Especie | InfraspecCateg | InfraEspecie | modificadores | AutorEspecie | Determinadores | AnoDet |
1101-1 | 25 | 1230 | Lauraceae | Licaria | cannella | subsp. | canella | cf. | Andrade, A.; Laurance, S. | 1995 |
Preparar uma planilha para cada versão colocando no nome do arquivo a data da versão
Arquivos Preparados por Ana Versão 01
Arquivos Preparados por Ana Versão 01
Erros detectados
Erros detectados
Correções Ana
Correções Ana
Registros duplicados
Registros duplicados
Encontrei registros duplicados nos arquivos preparados Ana Versão 01 no arquivo 01, 05 e 08 usando o script scriptverificaduplicados.r
Arquivos finais Identificação
Arquivos finais Identificação
O script scriptgeraarqimportacao.r gera os arquivos abaixo a partir dos arquivos preparados por Ana versão 01 acima e dups e semdups para 01, 05 e 08!
<fc #FF0000>Como nem todas as plantas mudaram de identificação ao longo dos anos, apenas os registros que mudaram de uma data para outra foram separados para importação no wiki. Os arquivos de cada data que foram importados estão</fc> aqui.
Passo 04 - Coleta e data de coleta
Passo 04 - Coleta e data de coleta
Essa planilha deve incluir apenas as árvores que foram coletadas
Parcela | Quadrante | Tagnum | Coletada | DataColeta |
1101-1 | 25 | 1230 | Sim | 1995-12-31 |
Passo 05 - Censos
Passo 05 - Censos
Preparar Arquivos
Preparar Arquivos
Subir aqui os arquivos de mortalidade e crescimento para cada reserva, em formato xls ou txt (ver abaixo). Irei construir um script para preparar os dados de todos os censos no seguinte formato:
|1101-1|25|1230|12.3|1995-12-31|cipo solto|morta|2005-08-30|arr raiz; vento|decomp|2010-05-01|
Arquivos Importados
Arquivos Importados
Notas sobre os arquivos para importação
Notas sobre os arquivos para importação
Os arquivos devem ser salvos em formato txt, exportado do OpenOffice para garantir compatibilidade de encoding (UTF8) que define os caracteres, e quebras de linha. Isso evita problemas de upload do arquivo ao sistema. Se preparou no excel, abrir o xls no OpenOffice (ou LibreOffice) e salvar como csv, escolhendo as mesmas opções da figura abaixo:
Importação Amostras INPA
Importação Amostras INPA
Dados extraídos do BRAHMS por Mike em duas ocasiões (a última em Outubro de 2013), foram usados para compilar um arquivo com registros de especímenes no INPA do PDBFF, que foi normatizado em vários aspectos, extraindo das informações das etiquetas o número da reserva e o número da árvore, identificadores únicos para os dados no PDBFF. Finalizando em 20 de Outubro de 2013, foram obtidos:
ARQUIVOS